霉菌进眼睛里，若自身抵抗力较强，由于机体可以抵御霉菌的侵袭，故而不会对机体造成严重不良影响。但是，若自身免疫力低下，则可能会引起眼部真菌感染，导致疼痛、角膜溃疡等不适反应。对于此类患者，建议及时去医院眼科就诊，可以在专业医生指导下，通过合适的方法治疗。

1、疼痛：对于免疫力低下的人群，霉菌进入眼睛后，如果不及时处理，可能会导致病菌长期刺激眼部，从而引起角膜发炎的情况。受炎性因子的刺激，容易引起眼睛疼痛，并可能伴随红肿、畏光、眼睛发痒、分泌物增多等症状；

2、角膜溃疡：对于眼睛感染霉菌的患者，若长时间不予以处理，随着感染情况加重，会引起局部频繁受到炎性因子的刺激，进而可能造成角膜溃疡的现象，导致视力降低、视力模糊、流泪等症状。

因此，建议患者及时就医，可以遵医嘱使用氟康唑滴眼液、伊曲康唑颗粒等多种药物治疗。患者不要过于担忧，可以适当休息，不要过度用眼，以免影响病情恢复。